鸡内源性白血病毒ev21与其侧翼区SNP位点的连锁关系

作者：葛琳涵; 白少川; 李雪梅; 赵丽杰; 乔宁; 李兰会^*

来源：河北农业大学学报, 2020, 43(06): 101-107.

DOI：10.13320/j.cnki.jauh.2020.0119

• 鸡
• 内源性白血病病毒ev21
• SNP
• 连锁
• 转录因子

鸡内源逆转录病毒ev21的转录表达影响宿主机体健康。本试验通过PCR检测海兰褐、太行鸡、海兰灰和SPF鸡292份DNA样品的ev21阴阳性、羽型和性别,测序筛选ev21插入位点OS和US区的SNP位点,MboII酶切检测C>T突变的群体多样性,分析C>T突变与ev21整合的连锁关系;最后利用TRANSFAC?Professional预测C>T突变引起的转录因子变化。测序峰图发现,ev21插入位点上游278 bp处的C>T突变。OS和US共有610 bp酶切结果发现,快羽ev21阴性鸡为CC基因型,快羽ev21阳性鸡为CT基因型;慢羽除海兰灰和海兰褐祖代ev21阳性鸡为TT基因型外,其他均为CT基因型。OS特异1 036 bp酶切显示ev21整合的OS区全部为T单倍型,C>T突变造成转录因子结合变化。研究表明ev21整合的OS区和未整合的US区的C>T突变有5种单倍型,ev21整合与T等位基因连锁。

• 单位
  华裕农业科技有限公司; 动物科技学院; 河北农业大学