天然无序蛋白质是一类特殊的蛋白质,在天然条件下不会折叠成特定的结构,却有着重要的生物学功能.分子动力学模拟是研究天然无序蛋白质的强大工具,能够提供实验无法观测到的结构和动力学信息.本文先总结了近年来全原子力场的发展以及不同力场在天然无序蛋白质体系中的表现,然后概述了水模型对蛋白质模拟的影响,最后介绍了分子动力学模拟在天然无序蛋白质结合过程研究上的应用.