钦州市钦南区HIV-1流行亚型及gag基因变异特征研究

作者：沈平; 苏齐鉴; 黄毅毅; 蒋丽萍; 张达燕; 郭继昌; 徐鸿庄; 韦建立

来源：中国热带医学, 2015, 15(11): 1289-1293.

DOI：10.13604/j.cnki.46-1064/r.2015.11.02

• 人类免疫缺陷病毒I型(HIV-1)
• 亚型
• gag基因
• 变异
• 基因离散率

目的了解钦州市钦南区HIV-1流行亚型及gag基因变异特征。方法在钦南区采集97名未抗病毒治疗HIV-1感染者的血液样本,从血浆中提取病毒RNA,从单个核细胞中提取前病毒DNA,采用PCR技术对HIV-1 gag基因片段进行扩增并测序。使用MAGA5.03软件对所得序列进行系统进化树分析,并计算gag区及各编码区段的基因离散率。结果获得72份样本gag基因序列,其中CRF01AE重组型占72.3%(52/72),CRF07BC重组型占13.9%(10/72),CRF08BC重组型占12.5%(9/72),G亚型占1.39%(1/72)。CRF01AE、CRF07BC和CRF08BC的gag基因离散率分别为0.049±0.004、0.053±0.005和0.059±0.005,差异具有统计学意义(P<0.01)。结论钦南区HIV-1主要流行亚型是CRF01AE,CRF 08BC亚型离散率大于CRF 01AE亚型和CRF 07BC亚型。

• 单位
  广西中医药大学附属瑞康医院