新型冠状病毒亚基因组RNA荧光重组酶介导等温扩增检测方法的建立及评价

作者：乔乔; 吴涛; 朱小娟; 葛以跃; 陈银; 崔仑标^*

来源：中国病毒病杂志, 2022, 12(06): 444-447.

DOI：10.16505/j.2095-0136.2022.0063

• 新型冠状病毒
• 亚基因组RNA
• 荧光重组酶介导等温扩增

目的 建立新型冠状病毒(SARS-CoV-2)亚基因组RNA(sgRNAs)荧光重组酶介导等温扩增(reverse-transcription recombinase-aided amplification, RT-RAA)检测方法。方法 根据SARS-CoV-2的5′-leader和7a、N基因序列设计特异性等温扩增引物和探针，在39℃等温条件下，30 min内对SARS-CoV-2的sgRNAs进行快速检测，并对该方法的灵敏度、特异度及与实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,real time PCR)法的一致性进行评价。结果 该方法检测限可达到20拷贝/μl,且与其他呼吸道病原体均无交叉反应，具有良好的灵敏度和特异度；与荧光定量PCR法相比，2种检测方法一致性较好(κ=0.762,P<0.001)。结论 本文建立的荧光RT-RAA法可用于SARS-CoV-2 sgRNAs的快速检测，对于临床样本感染性的快速诊断有重要意义。

• 单位
  江苏省疾病预防控制中心