谷子α-淀粉酶家族基因的全基因组鉴定与表达分析

作者：马荣博; 杨宇琭; 张丽玲; 韩渊怀^*

来源：山西农业大学学报(自然科学版), 2022, 42(06): 66-71.

DOI：10.13842/j.cnki.issn1671-8151.202206054

• 谷子
• α-淀粉酶
• 保守基序
• 基因结构
• 基因表达
• 转录组
• TBtools

[目的]α-淀粉酶是被子植物生命周期中的一种至关重要的酶，其主要参与植物籽粒成熟和种子萌发过程。本文旨在对谷子α-淀粉酶家族进行全基因组鉴定，并分析其转录组数据，了解其时空表达特性。[方法]采用blastp方法对谷子α-淀粉酶进行全基因组鉴定，并对其进行生物信息学分析。鉴定谷子α-淀粉酶家族基因11个，对其进行保守基序分析。[结果]α-淀粉酶基因家族成员具有相对保守的motif；基因结构分析表明，其成员间外显子数量差距较大，最少的为3个，最多的为13个；转录组数据表明，Si4g26540与Si5g29970在晋谷21中各时期均表达较高，尤其在种子萌发3 d和成熟种子30 d和60 d，表达最高，推测其在谷子籽粒成熟和种子萌发中发挥重要功能。Si1g33480、Si2g23620、Si2g23630和Si3g02050在种子萌发3 d时表达量最高，参与种子萌发。其它家族基因在根、叶中表达较高。[结论]谷子α-淀粉酶家族基因鉴定和表达分析为研究α-淀粉酶在谷子籽粒成熟和萌发中的功能奠定了基础。

• 单位
  山西农业大学