通脉逐瘀汤治疗动脉粥样硬化的网络药理学和分子对接研究

作者：任玲; 曹焕泽; 纪文岩^*

来源：山东中医药大学学报, 2022, 46(01): 91-100.

DOI：10.16294/j.cnki.1007-659x.2022.01.016

• 通脉逐瘀汤
• 动脉粥样硬化
• 网络药理学
• 分子对接
• 川陈皮素
• (+)-儿茶素
• 黄芩素

目的:采用网络药理学与分子对接技术探讨通脉逐瘀汤治疗动脉粥样硬化(AS)的潜在作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库(TCMSP)、分子机制的生物信息学(BATMAN)数据库、通用蛋白质资源(Uniprot)数据库获得通脉逐瘀汤的活性成分及其作用靶点;通过在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、基因卡片(Gene Cards)数据库、基因疾病关联(DisGeNET)数据库和毒性与基因比较(CTD)数据库获取AS的相关靶点并与通脉逐瘀汤作用靶点取交集;基于Cytoscape软件构建通脉逐瘀汤治疗AS的化合物-靶点-疾病网络并进行网络拓扑学分析;通过检索交互基因搜索工具(STRING)数据库构建靶点蛋白质交互作用(PPI)关系网络并进行网络拓扑学分析;利用AutoDockVina软件进行分子对接模拟;最终利用Bioconductor中的R包Cluster-profile version 3.12.0对交集靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛选到279种活性成分和586个靶点;分子对接模拟发现,川陈皮素、(+)-儿茶素、黄芩素等活性成分与关键靶点的结合活性较好;GO富集分析结果共有1749个GO条目,其中1627个生物过程条目、30个细胞组分条目和92个分子功能条目;KEGG通路富集分析结果共有94条通路,主要有低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、钙离子信号通路等通路。结论:通脉逐瘀汤可通过多成分、多靶点、多通路参与治疗AS。

• 单位
  山东中医药大学