高原粳稻群体遗传结构及其农艺性状与SSR标记的关联分析

作者：世荣; 刘吉新; 陈于敏; 李荣波; 郑晔; 张其钢; 吴志刚; 刘慰华; 赵国珍^*

来源：西南农业学报, 2022, 35(01): 1-7.

DOI：10.16213/j.cnki.scjas.2022.1.001

• 高原粳稻
• SSR标记
• 群体遗传结构
• 关联分析

【目的】分析高原粳稻主栽品种的遗传状况，寻找与农艺性状相关联的分子标记，为水稻新品种选育提供参考。【方法】在2种海拔条件下调查81份高原粳稻主栽品种的农艺性状，并利用48个SSR标记对供试品种进行多态性扫描和群体遗传结构分析，在此基础上采用Tassel 2.1 MLM(MixedLinear Model)方法进行SSR标记与农艺性状的关联分析。【结果】37个SSR标记在供试品种间具有多态性，共检测出139个等位变异，变异范围为2～10个，平均3.76个。群体遗传结构分析将供试品种分为2个亚群，关联分析表明，在P<0.05水平，2种环境下均检测出RM1195和RM209分别与株高和千粒重相关联，RM267、RM332、RM490、RM583和RM590与结实率相关联，各标记对表型变异的解释率在0.074～0.352。而在P<0.001水平，只有RM332与结实率相关联，该分子标记位于11号染色体上。【结论】检测出的7个标记可以为高原粳稻杂交配组及分子标记辅助育种提供理论依据。

• 单位
  昆明市农业科学研究院; 云南省农业科学院粮食作物研究所