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摘要
目的复合转座子Tn1548一直被认为介导了arm A基因的转移,本研究通过分析arm A基因在不同种属的基因环境,提出arm A基因转移的可能机制。方法以GenBank库不同种属细菌中已经发现的含有Tn1548及Tn1548-like转座子为研究对象,通过生物信息学技术比较分析arm A基因环境的差异,结合arm A基因环境中各种插入元件的工作机制,推测armA基因跨种属转移的可能机制。结果一共有11条含有Tn1548或者Tn1548-like的全质粒序列纳入分析。这些质粒序列来自不同种属,包括鲍曼不动杆菌、肠杆菌科细菌、铜绿假单胞菌。除鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌的质粒类型的不相容组别未知外,其他种属来源的质粒不相容组别涉及IncU、IncFII(Yp)、IncN、IncL/M、Inc L/M、IncA/C2和IncR嵌合型,IncA/C、IncFIIK和Inc T。上述结果强烈的提示arm A基因的跨种属转移不是质粒的广泛播散而更可能是转座子或者更小的可移动元件参与其中的事件。进一步对Tn1548、Tn1548-like转座子及Tn1548相关区域的分析发现了arm A基因在转移中侧翼的相对保守区是ISCR1-arm A-IS26结构。结论结合ISCR1和IS26元件的工作机制,推测ISCR1-arm A-IS26结构极有可能介导了armA基因在不同种属的广泛播散。
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