药食同源蔬菜赤苍藤SCoT分子标记体系的优化及引物筛选

作者:杨天为; 黄诗宇; 张尚文*; 高曼熔; 张向军; 李婷; 庾韦花; 蒙平; 石前
来源:中国瓜菜, 2023, 36(01): 48-52.
DOI:10.16861/j.cnki.zggc.2023.0020

摘要

笔者以24份不同来源地的野生赤苍藤种质为试验材料,采用L9(33)正交试验对赤苍藤SCoT-PCR反应体系进行优化,并通过优化后的体系进行引物筛选,结果表明,PCR体系中各因素对多态性结果的影响程度排序为DNA模板量>引物用量>2×Taq Master Mix用量。最佳反应体系(20μL)为1 μL DNA模板(50 ng·μL-1)、1.2 μL引物(10 μmoL·μL-1)、10 μL 2×Taq Master Mix和7.8 μL ddH2O。通过该体系从36条SCoT引物中筛选出14条稳定性好、多态性高的引物,并确定了最佳退火温度。该体系的建立和引物的筛选将为后续开展赤苍藤种质资源收集与保护、遗传多样性研究和分子育种提供参考依据。

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