不同地区穇子ITS序列比较及穇属物种聚类分析

作者：李基光; 汤睿; 欧立军; 王艳兰; 王利群; 陈光辉^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(24): 8081-8091.

DOI：10.13271/j.mpb.018.008081

• 穇子(Eleusine coracana)
• ITS
• 分子鉴定
• 聚类分析

穇子作为药食兼用的特色作物,对粮食安全和改善人们健康起着重要作用。为探究快速鉴定穇属物种的方法及确定穇子的亲缘关系,本研究对65个不同产地穇子居群的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列进行测序及比对,并构建穇属物种系统发育树。结果发现,穇子EC25、EC53和EC59等3个居群的ITS序列存在单碱基的突变体,其他居群无任何差异;穇属物种间ITS存在3～43个碱基的差异;系统聚类表明,穇属物种分为2大类4个亚组,其中穇子与凯芝济穇亲缘关系最近。研究表明,穇子的ITS序列具有高保守性而穇属种间差异性较大,ITS序列不能作为穇子居群的鉴定标记,可作为穇属物种鉴定的参考序列。本研究为穇子的亲缘关系鉴定及杂交育种提供了分子依据。

• 单位
  湖南省作物研究所; 湖南农业大学