利用比较基因组学快速鉴定大肠埃希菌噬菌体耐受基因

作者:邢少贞; 赵飞扬; 孙强; 米志强; 安小平; 童贻刚; 赵宝华
来源:中国抗生素杂志, 2017, 42(10): 871-879.
DOI:10.13461/j.cnki.cja.006095

摘要

噬菌体是解决致病菌多重耐药性问题的最佳选择之一,然而噬菌体的宿主特异性使得噬菌体的裂解谱有限,因此研究噬菌体宿主特异性对于噬菌体治疗应用具有重要意义。本研究通过筛选大肠埃希菌宿主菌BL21噬菌体IME253的耐受菌,结合对敏感菌和耐受菌的高通量测序,分析基因组差异,预测噬菌体耐受相关基因,发现耐受与外膜受体蛋白FepA有关。然后利用向导CRISPR/Cas9切开敏感菌fepA基因,同时利用Red同源重组系统无痕敲除fepA基因,证明fepA基因敲除可以导致细菌BL21对噬菌体IME253耐受。本实验利用比较基因组学分析平台,建立了一种宿主耐受噬菌体的分析方法,并且利用CRIPSR无痕敲除技术来验证耐受相关基因,为噬菌体治疗提供理论基础。

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