摘要
目的:探索氧化应激和免疫浸润在特发性肺纤维化中的作用及关系,并预测相关治疗中药及有效成分。方法:从GEO数据库下载GSE10667基因表达谱获取差异表达基因,结合氧化应激基因鉴定氧化应激差异表达基因(DEOSGs)。采用GSEA评价IPF中的通路及生物过程,并对DEOSGs进行GO、KEGG及PPI网络分析。通过PPI结果和CytoHubba得出候选中心基因,将GSE110147作为独立组验证确定中心基因;此外,我们利用CIBERSORTF评估样品的免疫微环境,并探讨了中心基因水平与免疫细胞相对比例之间的相关性;最后,通过中心基因预测了治疗中药及成分,并进行了分子对接验证。结果:得到51个DEOSGs;4个中心基因ICAM-1、APOE、MMP-1、TGFβ-2;DEOSGs主要与氧化应激、免疫反应等有关;4个中心基因水平与8个免疫细胞相对比例密切相关;治疗中药有黄芪、川芎等4味,有效成分包括β-胡萝卜素等8种,分子对接结果稳定。结论:IPF中存在氧化应激与免疫发应,且氧化应激可能被免疫细胞识别或直接激活免疫细胞。
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