CECMAtlas 1.0:人类肿瘤相关的细胞外基质基因数据库（英文）

作者：于淑婷; 刘源; 徐浩; 李扬; 刁丽红; 张怡; 朱佳润; 胡圣伟^*; 李栋^*

来源：中国生物化学与分子生物学报, 2021, 37(02): 207-213.

DOI：10.13865/j.cnki.cjbmb.2020.12.1471

• 癌症
• 细胞外基质基因
• 数据库
• 文本挖掘
• 人工判读
• 生物学过程

细胞外基质(extracellular matrix, ECM)是细胞微环境的重要组成部分,它不仅能为细胞提供物理支持,而且还参与了多种生物学过程。近年来,已经鉴定出来数百种与癌症相关的ECM(cancer-related ECM,C-ECM)基因,其中一些已作为潜在靶标。目前,有关于C-ECM基因的丰富信息还散布在成千上万的出版物中,并且它们在肿瘤发生过程中的作用也未被系统的整理。本文构建了CECMAtlas数据库(http://biokb.ncpsb.org.cn/CECMAtlas/),该数据库使用文献挖掘和人工判读收集了225个C-ECM基因,以及相关生物学过程信息,该数据库将有助于研究肿瘤的发生机制和开展可能的临床应用。

• 单位
  安徽医科大学; 基础医学院; 河北大学; 生命学院; 生命科学学院; 蛋白质组学国家重点实验室; 石河子大学