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摘要
采用生物信息学的研究方法,应用一系列工具软件分析研究钝顶螺旋藻Fts Z蛋白,以认识钝顶螺旋藻Fts Z蛋白一级和二级结构,并为进一步研究该蛋白空间结构和功能机制奠定理论基础。获得钝顶螺旋藻Fts Z蛋白一级结构相关理化参数的详细数据,预测蛋白二级结构,对蛋白的3D结构进行了同源建模、质量评价分析。研究结果表明钝顶螺旋藻Fts Z蛋白是一种酸性蛋白,主要定位于细胞核区;蛋白二级结构主要由无规则卷曲和α-螺旋两种结构组成;同源建模后得到的3D模型在空间构象上有较高的合理性,其中模型A有100%氨基酸残基数落于Ramachandran图的允许区,该模型含有14个α-螺旋结构,5个βα-β单位,2个β-折叠结构,1个β-发夹结构,16个β-转角和1个γ-转角。
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