摘要
目的:我们先前的体外肝微粒体抑制活性实验,已证实芹菜索和山萘酚对细胞色素CYP 1A2有较强的抑制作用.然而,其抑制机理仍然未知.分子模拟方法能更好了解这2个天然产物对1A2的抑制机理.方法:采用分子对接、分子动力学模拟及结合自由能计算的方法,研究它们对1A2的抑制作用.结果:芹菜素和山萘酚对1A2的预测结合自由能分别是-18.01和-16.40 kcal/mol,这与实验抑制活性结果一致.在1A2结合口袋中,残基呈平面性排列,与平面芹菜索和山萘酚存在紧密的范德华和疏水相互作用,因而小分子有较强的抑制作用.此外,活性位点残基也与小分子发生氢键和盐桥等相互作用,使小分子在结合口袋中的位置得到固定.
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