食管鳞状细胞癌差异性表达circRNA的初步筛选和分析

作者：张德海^*; 付正; 王健; 王国君; 黄军贤; 陈熹

来源：中国肿瘤生物治疗杂志, 2020, 27(09): 1012-1017.

DOI：10.3872/j.issn.1007-385x.2020.09.008

• 食管鳞状细胞癌
• 环状RNA
• 差异表达
• 生物学作用
• 高通量测序

目的:构建食管鳞状细胞癌的circRNA表达谱,分析差异性表达的circRNA。方法:标本取自2018年6月至2019年2月在江苏大学附属金坛医院胸外科住院的3例食管鳞状细胞癌手术患者,利用高通量测序技术构建circRNA表达谱,检测3对食管鳞状细胞癌组织和癌旁组织中差异表达的circRNA,并运用GO和KEGG技术分析这些circRNA涉及的生物学作用和相关的信号通路。结果:通过构建的表达谱分析比较食管鳞状细胞癌组织与癌旁组织circRNA的表达水平,共发现了905个差异表达的circRNA,其中404个表达上调、501个表达下调,hsacirc0004390是上调倍数最大的circRNA(FC=7.9712),novelcirc0012687是下调倍数最大的circRNA(FC=5.8796)。GO和KEGG分析表明,这些circRNA可能涉及癌细胞的细胞周期、细胞组分、蛋白质结合作用等生物学过程和Hippo、cGMP-PKG等信号通路。结论:食管鳞状细胞癌组织circRNA表达谱分析得到的高度显著差异表达的circRNA似可以作为食管鳞状细胞癌潜在的生物标志物。

• 单位
  江苏大学; 南京大学; 生命科学学院