饲料不同水平磷脂和胆固醇对克氏原螯虾肝胰腺转录组的影响

作者：侯受权; 侯梦娜; 李嘉尧^*; 成永旭^*

来源：基因组学与应用生物学, 2022, Z2: 2076-2088.

DOI：10.13417/j.gab.041.002076

• 磷脂
• 胆固醇
• 克氏原螯虾
• 转录组

为研究饲料中磷脂和胆固醇不同添加水平对克氏原螯虾(Procambarus clarkii)肝胰腺转录组的影响，采用3×3因子试验法，设计3个磷脂(phospholipid, PL)水平(0、 20、 60 g/kg)和3个胆固醇(cholesterol, CH)水平(0、5、 10 g/kg)共9种饲料，分别标记为A～I组。饲喂克氏原螯虾雌性幼虾60 d后，基于RNA-seq技术对其肝胰腺的转录组数据进行分析。测序共得到508 051个Unigenes,平均长度为521.6 bp。设置显著差异基因筛选条件为P<0.05并随机选取若干显著差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)进行实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR, RT-qPCR)验证。对高添加量(PL 60 g/kg; CH 10 g/kg)I组、中添加量(PL 20 g/kg; CH 5 g/kg)E组和低添加量(PL 0 g/kg; CH 0 g/kg)A组肝胰腺样本的测序文库分别进行两两比较。GO功能富集分析结果显示，差异表达基因主要集中在生长、繁殖、免疫系统过程、代谢过程等通路中；KEGG通路富集分析发现脂肪的消化吸收、卵巢类固醇生成、脂肪酸生物合成、维生素消化吸收、甘油酯脂代谢等过程被显著富集，与脂质代谢和类固醇激素合成相关的差异表达基因均显示显著上调(P<0.05)。本研究为探究饲料中磷脂和胆固醇调控克氏原螯虾生长发育机制等方面提供参考数据。

• 单位
  上海海洋大学; 生命学院