向日葵HafabZ基因的生物信息学和表达分析

作者：周菲; 王文军; 刘岩; 黄绪堂^*; 吴立仁; 王静; 姚玉波; 李明东

来源：黑龙江农业科学, 2021, (07): 11-14.

• 向日葵
• 油酸
• HafabZ
• 生物信息学
• 表达分析

为进一步了解向日葵HafabZ基因的表达特性及功能,通过数据库检索(NCBI)及荧光定量PCR等方法对向日葵HafabZ编码蛋白进行生物信息学和表达模式分析。结果表明:预测HafabZ编码蛋白为酸性且为亲水性蛋白,二级结构主要为无规则卷曲,预测亚细胞定位于叶绿体;系统进化分析发现,HafabZ与薇甘菊fabZ进化关系最近,序列相似性为83%;HafabZ基因表达分析结果表明,在向日葵"L-1-OL-1"开花后7d,HafabZ在向日葵中表达量从高到低排序为:种子>舌状花>管状花>叶>茎>根。在种子发育不同时期,HafabZ在高、低油酸向日葵材料发育前期种子中表达量均较高,均在开花后17d表达量达到最高,之后均明显下调,在开花后22和27d,高油酸向日葵中表达量明显低于低油酸向日葵,表明这段发育时期HafabZ在高、低油酸向日葵种子中可能存在不同的表达调控机制。

• 单位
  黑龙江省农业科学院; 黑龙江省农业科学院经济作物研究所