鸡胚卵巢基因共表达网络模块的构建及功能分析

作者：任一帆; 孟婕; 杨晴; 张贝; 李可强; 张传生^*; 耿立英; 赵雪艳; 李祥龙

来源：河北科技师范学院学报, 2021, 35(04): 34-46.

• 鸡胚
• 卵巢
• 加权基因共表达网络分析

为构建鸡胚卵巢的基因共表达网络模块,挖掘鸡卵巢发育相关功能基因,通过加权重基因共表达网络分析(WGCNA),利用鸡胚卵巢转录组测序数据构建了共表达模块,并对模块进行生物学过程、KEGG通路和蛋白互作网络分析,筛选出与鸡卵巢发育密切相关的枢纽基因。结果表明:共鉴别出8个共表达模块,对其中6个模块进行富集性分析并选出2个特征性模块:青色和红色,选出模块的候选枢纽基因进行蛋白互作网络分析并筛选出2个模块的枢纽基因,分别是:CDC5L和PLG;并从鸡两侧卵巢发育角度对2个模块进行了功能分析。

• 单位
  河北科技师范学院; 山东省农业科学院