NOD1基因多态性与牛结核病的易感相关性分析研究

作者：王坤; 高伟娜; 杨霄; 况修冬; 周渊博; 赵战勤^*; 薛云^*

来源：中国预防兽医学报, 2023, 1-8.

• 牛结核病
• NOD1基因
• SNPs
• 易感性

为探究中国荷斯坦奶牛NOD1基因多态性与牛结核病易感相关性,本研究以提取的牛结核病组与对照组共260份的全血样本基因组DNA为模板,利用“PCR+DNA测序分析”方法筛选NOD1编码区单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)位点,应用统计学软件SPSS. 16.0分别统计牛结核病组与对照组的SNPs等位基因与基因型的分布频率差异。通过分布频率差异的p值、OR值、95%CI值,鉴定牛结核病易感相关的SNPs位点。结果显示:在中国荷斯坦奶牛NOD1的编码区共筛选出7个SNPs位点,鉴定出2个牛结核病易感相关的低风险SNPs位点rs42935035和rs466132550。利用生物信息学软件预测牛结核病易感相关的SNPs位点对NOD1基因mRNA二级结构、蛋白质二级结构和三级结构的影响。结果显示:rs466132550为同义突变,rs42935035为错义突变,导致半胱氨酸(Cys)变为精氨酸(Arg)。rs42935035、rs466132550突变后引起mRNA二级结构自由能提高,导致mRNA二级结构稳定性降低。rs42935035位点突变后并未引起蛋白质二级结构、三级结构发生改变。本研究有助于从宿主分子遗传学的角度阐明牛结核病的发病机理,也提供了一种区分结核高风险牛群的新方法。

• 单位
  动物科技学院; 河南科技大学