基于RNA-Seq分析氨气对肉兔卵丘卵母细胞复合体的影响

作者：崔嘉; 吴峰洋; 杨新宇; 樊长林; 陈宝江^*

来源：中国兽医学报, 2021, 41(11): 2280-2287.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2021.11.30

• S814氨气
• 肉兔
• 卵丘卵母细胞复合体
• 转录组

本试验旨在研究氨气对肉兔卵丘卵母细胞复合体(COCs)的影响。选取100只35日龄雌性肉兔于环境控制仓内,控制氨气浓度分别为0.0 mg/m3(CG组)与7.6 mg/m3(LAC组),试验期28 d。使用苏木精-伊红染色法(HE)检测卵巢组织结构完整性,并采用高通量转录组测序RNA-Seq技术对肉兔COCs进行检测,对检测结果进行拼接与质量评估,筛选出差异表达基因,并进行GO和KEGG功能分析,同时用荧光定量PCR对5个与卵泡发育有关的差异表达基因进行验证。结果表明,氨气处理后肉兔卵巢组织结构完整性被破坏,与对照组(CG组)相比,LAC组原始卵泡与初级卵泡的数量极显著降低(P<0.01),闭锁卵泡增多(P>0.05)。CG与LAC组的差异表达基因(differently expression genes, DEGs)数量为3 345个,其中显著上调DEGs 1 093个,显著下调DEGs 2 252个,其中发现多个与繁殖相关的高表达基因,如SIRT1、KIRREL、IGFBP2、Pik3r1、KDM2B和LHCGR等基因。结合GO富集分析,发现差异表达基因主要富集于49个条目,这些基因主要富集在DNA转录调控、细胞质、核、胞质溶胶成分及各种物质的结合方面。KEGG通路分析表明,差异基因主要参与卵母细胞减数分裂与孕激素介导的卵母细胞成熟通路,以及参与细胞增殖和分化、激素调节功能的PI3K-Akt、Rap1、Hippo、FoxO和TGF-beta信号通路等31个信号通路。本试验为进一步阐明氨气影响肉兔的生殖调控提供了依据。

• 单位
  动物科技学院; 河北农业大学