山西不同产地酸枣仁的ITS序列比较研究

作者：裴香萍; 闫艳^*; 杜晨晖; 丁雯; 李慧杰; 郭莉琛

来源：中华中医药杂志, 2020, 35(06): 3173-3178.

• 酸枣仁
• ITS序列
• 鉴定
• 聚类分析

目的:通过分析山西不同产地酸枣仁核糖体基因内部转录间隔区序列,为酸枣仁药材鉴定提供DNA分子标记方法。方法:采用植物基因组DNA快速提取试剂盒的方法,提取22个不同产地酸枣仁药材中的总DNA,以通用引物采用PCR扩增rDNA-ITS序列并测序。采用contig分析软件进行序列拼接、CLUSTAL X软件进行序列比对,再使用MEGA 7.0软件进行遗传分析并构建系统发育树。结果:种内变异位点分析共获得22条ITS序列,11个单倍型,根据单倍型的数目,单倍型1、单倍型2、单倍型3为酸枣仁的核心单倍型,占所有条带的60.87%。种间序列分析NJ树分为两大支,正品酸枣仁与伪品枳椇子各一支,聚类分析可以对酸枣仁及其伪品ITS序列差异进行识别。结论:rDNA-ITS序列可用于对山西不同产地酸枣仁的分析,是酸枣仁药材分子鉴定的有效方法之一。

• 单位
  山西中医药大学; 山西大学