胃腺癌中免疫基因组表达及临床意义

作者:王文生; 朱建儒; 慕之勇; 刘碧颖; 王斌; 陈东风*; 文良志*
来源:胃肠病学和肝病学杂志, 2020, 29(05): 507-514.

摘要

目的探讨胃腺癌(gastric adenocarcinoma,GAC)中免疫相关基因的表达情况,寻找潜在的免疫治疗靶点。方法基于TCGA数据库中GAC全基因组测序,利用生物信息学方法,分析在肿瘤中异常表达的免疫相关基因,进一步筛选影响患者预后的免疫基因,Kaplan-Meier网站进行验证。通过Cytoscape软件预测可能的转录调控机制,Cox回归构建预测患者预后的风险模型并评价临床实用性。结果 6 685个基因在GAC癌组织与癌旁组织中有差异表达,其中366个为免疫相关基因,而与预后密切相关的免疫基因有33个。多因素Cox回归分析筛选出12个(TAP1、CXCL6、CTSG、CCL21、RNASE2、IGHD2-15、EDN2、PLAUR、GCG、RETN、RLN2、GLP2R)免疫基因构建风险模型。Kaplan-Meier网站验证TAP1、CTSG、RETN、GLP2R明显与患者预后相关。临床相关性上,该模型能反映肿瘤淋巴结转移情况,而与患者年龄、性别、肿瘤分期无相关性(P>0.05)。通过Pearson相关分析,我们还发现该模型能够一定程度上反映树突状细胞、巨噬细胞、中性粒细胞在肿瘤微环境中的浸润情况。结论我们筛选出了与GAC患者预后密切相关的多个差异性表达的免疫基因,并在此基础上建立了一个能有效预测预后的风险评分模型,为将来的免疫治疗提供了新思路和潜在治疗靶点。