上海市环境污水监测埃可病毒11型基因特征和循环动态

作者：李云逸; 陆菁; 杨玉颖; 费洁; 张莉萍; 李智; 胡家瑜; 李崇山^*

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2020, 34(03): 270-275.

• 埃可病毒11型
• 监测
• 基因特征
• 循环

目的探讨基于上海市环境污水监测中埃可病毒11型(echovirus 11, Echo11)的基因特征和循环动态变化。方法本研究对上海市2012—2019年环境污水监测获得的Echo11分离株进行了VP1区核酸扩增和序列测定, 结合上海市急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis, AFP)监测系统和健康儿童肠道病毒监测中Echo11分离株以及Echo11参考株进行序列同源性分析和系统发生学分析。结果上海市3个监测系统来源Echo11分离株共有156株, 其中2012—2019年环境污水共分离到136株, 其流行高峰主要集中在夏秋季。上海市不同来源Echo11分离株进化速度较快, 有40.3%存在第54位氨基酸位点突变。上海市不同来源Echo11共有5个基因亚型传播链, 即A1、A2、C1、C3和D5基因亚型。2012年, 环境污水、AFP病例和健康儿童之间存在A1基因亚型Echo11共循环现象。2012—2015年的优势传播链为A1基因亚型, 从2016年开始, 优势传播链逐渐变为D5基因亚型。结论环境污水监测真实反映人类肠道病毒(human enterovirus, HEV)的循环状况, 对于HEV相关疾病预测预警具有实际意义。

• 单位
  上海市疾病预防控制中心; 上海市闵行区疾病预防控制中心