长尾大眼鲷COI基因序列的遗传多样性分析

作者：姜芳燕; 韩冰冰; 李语; 王辉芳; 杨宁; 黄海^*

来源：海南热带海洋学院学报, 2020, 27(02): 6-10.

DOI：10.13307/j.issn.2096-3122.2020.02.02

• 长尾大眼鲷
• COI基因
• 序列变异
• 遗传多样性
• 种群扩张

本研究对克隆获得的17条长尾大眼鲷COI基因片段序列进行比较分析,结果表明:所得基因片段长度为636 bp.A,T,G,C碱基的平均含量分别为22. 3%,27. 4%,19. 3%,31. 0%,G+C在密码子的第1～3位的平均含量为39. 8%～56. 0%,表明4种碱基在密码子中出现频率有较明显的偏好性.17条COI序列的单倍型多样性(Hd)为0. 735,共定义了9个单倍型,其核苷酸多样性(Pi)为0. 020 81,平均碱基差异(K)为13. 027 78,Tajima’s D的中性检验结果是-1. 992 73,P <0. 01,差异极显著,说明南海长尾大眼鲷种群经历过扩张事件,由此推测其是由一个较大的种群经过长时间进化而来,也可能是由2个以上不同的种群2次接触后演化而来.

• 单位
  海南热带海洋学院; 三亚市南繁科学技术研究院