斑玉蕈栽培菌株遗传变异与生长速率GWAS分析

作者：龚明; 李燕; 鲍大鹏; 尚俊军; 杨瑞恒; 周陈力; 万佳宁; 吴莹莹^*

来源：食用菌学报, 2021, 28(02): 18-25.

DOI：10.16488/j.cnki.1005-9873.2021.02.003

• 斑玉蕈
• 遗传变异
• 生长速率
• SNP
• GWAS

以38份斑玉蕈(Hypsizygus marmoreus)种质资源为研究对象,采用全基因组重测序获得供试菌株的SNP(single nucleotide polymorphism)数据,结合在不同温度(10、15、20、25、30℃)下的菌丝生长速率测定结果,开展全基因组关联分析(genome wide association study, GWAS)。结果表明:供试群体分为4大类群;在实验范围内,20、25℃为斑玉蕈适宜生长温度;GWAS分析显示20、25℃分别存在10、14个与生长速率显著关联的SNP位点,其中1个属于潜在功能性SNP位点。

• 单位
  上海市农业科学院食用菌研究所