摘要
目的 应用宏基因二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)检测非中性粒细胞减少性侵袭性肺真菌感染(invasive pulmonary fungal infection, IPFI)患者肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid, BALF)真菌表达,探讨其病原检测价值。方法 59例非中性粒细胞减少性IPFI患者,均行支气管肺泡灌洗术采集BALF标本,采用mNGS、传统培养、G试验/GM试验检测病原体。比较3种方法真菌检出率、检出时间;分析mNGS和传统培养检出真菌的分布情况;比较抗菌药物暴露对mNGS、传统培养及G试验/GM试验的影响。结果 mNGS真菌检出率(76.27%)高于传统培养(49.15%)和G试验/GM试验(52.54%)(P<0.05),检出时间[(22.73±0.70)h]短于传统培养和G试验/GM试验[(98.68±1.26)、(26.42±0.73)h](P<0.05)。mNGS检出真菌60株,其中念珠菌21株,曲霉菌25株,耶氏肺孢子菌6株,新生隐球菌5株,毛霉菌3株;传统培养检出真菌29株,其中念珠菌19株,曲霉菌10株。43例应用抗菌药物者mNGS真菌检出率(76.74%)高于传统培养(46.51%)和G试验/GM试验(55.81%)(χ2=8.310,P=0.004;χ2=4.214,P=0.040)。结论 应用mNGS技术可提高非中性粒细胞减少性IPFI患者BALF标本的真菌检出率和检出真菌的种类,缩短检测时间,且检测结果受应用抗菌药物的影响较小,但mNGS存在漏诊情况,不能完全取代传统培养。
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单位郑州大学第二附属医院