基于蛇足石杉转录组测序筛选及分析光周期相关基因

作者：**甦^*; 许义红; 陆廷祥; 刘杰; 孙晓慧; 邓莹

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(12): 5736-5743.

DOI：10.13417/j.gab.039.005736

• 蛇足石杉
• 转录组
• 差异表达基因
• 光周期基因筛选

蛇足石杉(Huperzia serrata (Thunb.) Trevis)是石杉科植物,其含有石杉碱等成分具有药用价值。但该植物生长缓慢、栽培不稳定、生物产量低。光周期(Circadian rhythm)基因对于植物的生长发育非常关键。本研究通过对蛇足石杉的根、茎、叶、芽和孢子进行转录组测序,得到82 238个unigenes,平均长度为958 bp,本地blast显示本实验转录组测序结果与之前报道的结果相似性高、结果可靠。通过比较和分析差异基因,进一步在光周期通路中筛选出294个基因,构建了22个显著差异表达基因的相互作用网络并进行分析,指出潜在的关键基因为COP1、LHY、PIF3及CDF1等。这些结果为深入开展蛇足石杉孢子对光线的反应及环境适应等研究提供了理论依据。

• 单位
  黔南民族医学高等专科学校