摘要

以在NCBI数据库中注册的番茄PRDX蛋白为分析对象,利用生物信息学方法,分析了其蛋白的理化性质、信号肽、保守域结构以及系统进化等特点。结果表明:蛋白的稳定性较差,多为亲水性蛋白;氨基酸序列中不包含信号肽,不是分泌蛋白;经过跨膜结构预测,发现该基因均无明显的跨膜结构域;番茄PRDX中存在最多的潜在N-糖基化位点为9个,存在最多的潜在O-糖基化位点为21个;二级结构预测结果显示,以α-螺旋和无规则卷曲为主,三级结构具有极大相似性;系统进化树及保守结构域分析结果显示,各亚型均具有保守的功能结构域和基因结构,其中PRDX-2、PRDX-2E-2与PRDX-Q的亲缘关系较近,PRDX-2F和PRDX-A的亲缘关系较近。该研究为探索番茄抗氧化酶功能研究提供参考,为进一步研究番茄基因组学奠定基础。