基于转录组的荔枝泛素结合酶基因家族的鉴定及表达分析

作者：董晨; 李金枝; 郑雪文; 王弋; 李伟才^*

来源：热带作物学报, 2022, 43(05): 882-892.

DOI：10.3969/j.issn.1000-2561.2022.05.002

• 荔枝
• 泛素结合酶
• 基因家族
• 表达分析

泛素结合酶在泛素化级联反应中居于中心位置，是连接泛素活化酶和泛素连接酶的桥梁，在泛素化系统中发挥着关键作用。本研究基于荔枝转录组数据库，利用生物信息学方法对转录组数据库泛素结合酶UBC基因家族进行鉴定，最终得到28个LcUBC基因家族成员。通过荧光定量PCR技术对LcUBC基因家族在‘妃子笑’荔枝不同组织中进行时空表达分析，并对花穗对照和烯效唑处理花穗发育的不同时期进行表达分析。结果表明：LcUBC基因家族成员对应所编码的氨基酸数分布在85～1146aa之间，等电点大小在4.03～9.61之间，5个LcUBC蛋白为稳定蛋白，其余均为不稳定蛋白。2个LcUBC蛋白定位于细胞质，2个LcUBC蛋白定位于细胞质和细胞核，1个LcUBC蛋白定位于内质网，其余蛋白均定位于细胞核。系统进化分析结果表明，LcUBC蛋白分为10个亚家族；28个LcUBC基因家族成员在不同组织的表达量存在差异；烯效唑处理‘妃子笑’荔枝花穗与对照相比，烯效唑处理21 d后，LcUBC基因家族成员的多个基因表达量较高。这是在转录组水平分析LcUBC基因家族成员，本研究结果对今后该基因家族的分类、克隆和功能研究提供了参考依据。

• 单位
  中国热带农业科学院南亚热带作物研究所