基于生物信息学分析尤文肉瘤的差异基因表达及功能预测

作者：韩广弢; 李皓桓^*

来源：中国医药生物技术, 2021, 16(01): 27-31.

• 生物信息学
• 尤文肉瘤
• GEO

目的基于生物信息学分析尤文肉瘤的基因差异表达及功能预测,为尤文肉瘤的治疗提供帮助。方法通过GEO数据库寻找RNA数据集,通过limma包寻找差异基因并寻求可视化,对其进行信号通路分析和GO富集分析,最后进行基因互作网络的分析。结果在尤文肉瘤组织中共筛选出312个基因具有差异,其中192个上调基因,120个下调基因。通过细胞组成的研究,细胞外区域组分、细胞外区域、细胞外小泡、细胞外细胞器、细胞外泌体对尤文肉瘤影响较大。通过对生物进程的分析,细胞分化、系统发育、解剖结构、细胞发育、细胞发育过程影响较大。通过对分子功能的研究,蛋白结合、细胞黏附结合、蛋白质二聚体结合、胰岛素II受体结合、细胞外基质结合影响较大。通过基因互作网络发现,ANXA2和S100A10,ANXA2和S100A4,GRP和CCK,LAMA5和ITGA3,SCNN1A和SG1C1互作关系较为密切。结论 ANXA2和S100A10,ANXA2和S100A4,GRP和CCK,LAMA5和ITGA3,SCNN1A和SG1C1互作关系较为密切,这些相互作用的基因编码蛋白可能调控尤文肉瘤的产生。

• 单位
  武汉大学人民医院