食管鳞癌中神经纤毛蛋白2基因断裂和重排的分析与鉴定

作者：程潇钰; 郝佳洁; 宫婷; 商利; 蔡岩; 张钰; 徐昕; 王明荣

来源：国际遗传学杂志, 2016, 39(05): 233-239.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1673-4386.2016.05.001

• NRP2
• 基因断裂
• 基因融合

目的分析食管鳞癌中的基因断裂及重排,旨在为食管鳞癌的诊断及治疗提供分子标志和新的治疗靶点。方法通过对食管鳞癌手术标本进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)微阵列检测,首先发现基因内部断裂;采用cDNA末端快速扩增法(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术鉴定与断裂基因残留部分融合的新的染色体片段,采用蛋白免疫印迹(Western blotting)和免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)方法检测基因断裂后的表达情况;利用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术检测候选基因在较大临床样本中的断裂频率。结果 SNP微阵列分析6例食管鳞癌手术组织,在2例标本中发现2号染色体长臂33.3区段的NRP2基因内发生了断裂。3′-RACE分析结果表明,在其中1例的互补DNA水平存在神经纤毛蛋白2-膜联蛋白A1 3基因(NRP2-ANXA13)融合转录本。通过FISH进一步分析16例食管鳞癌组织,发现6例存在NRP2断裂,其中2例疑似存在NRP2-ANXA 13重排。Western印迹和IHC分析结果显示,发生NRP2-ANXA13融合病例标本的正常NRP2蛋白表达与癌旁组织相比显著下调。结论在食管鳞癌组织中存在NRP2基因的高频断裂和NRP2-4NXA 13的基因融合,该结果为探明食管鳞癌中基因断裂和重排的作用及机制提供了新的重要线索。

• 单位
  中国医学科学院北京协和医学院; 分子肿瘤学国家重点实验室