高温环境样品总DNA直接和间接提取方法的比较

作者：刘宏伟; 彭谦; 李沁元; 肖炜; 崔晓龙; 林连兵; 刘志坚; 姜成林; 徐丽华; 陈义光; 王治刚; 任禛; 邓岚; 文孟良

来源：微生物学报, 2006, (6): 1018-1022.

DOI：10.3321/j.issn:0001-6209.2006.06.032

• 菌席
• 环境DNA
• 间接DNA提取法
• PCR-DGGE

分别采用两种环境总DNA直接提取法和一种间接提取法从6种温泉菌席样品中提取总DNA,以DNA粗产物的纯度、能否用于后续PCR扩增及PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)所反映的微生物多样性为评价指标对两类方法进行比较和评价.研究发现,虽然间接提取法效率低下,但对于高温极端环境中生物量较小的样品,间接法能得到有研究价值的、纯度较高的环境样品总DNA,而直接法得到的DNA量小且不适于PCR扩增操作.在使用这2类方法都能得到可用于研究操作的DNA的情况下,间接提取法能更好的体现环境样品中微生物的多样性.

• 单位
  云南省微生物研究所; 昆明理工大学; 云南大学