基于脂质代谢基因构建胃癌预后预测模型

作者:徐雪莹; 章燕; 叶开; 钟峰*
来源:牡丹江医学院学报, 2023, 44(04): 29-34.
DOI:10.13799/j.cnki.mdjyxyxb.2023.04.011

摘要

目的 基于胃癌脂质代谢相关基因建立预后风险模型,评价预后风险模型与免疫浸润的关系,为胃癌预后预测提供数据支持。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和GEO数据库中筛选与胃癌预后相关的脂质代谢基因。使用LASSO回归和多因素Cox回归分析构建预后风险模型。使用Kaplan-Meier分析和ROC曲线分析验证预后风险模型的预测效能。xCell分析用于识别高低风险组的免疫状态。构建整合风险模型和临床特征的诺模图。qRT-PCR验证OSBPL1A和MOGAT1在胃癌组织中的表达水平。结果 筛选得到胃癌脂质代谢相关预后基因OSBPL1A和MOGAT1并构建预后风险模型,根据风险评分中位数将胃癌患者分为高风险组与低风险组。低风险组患者的总体生存率显著优于高风险组患者(TCGA-STAD和GSE62254,P均<0.05)。时间依赖性ROC分析表明构建的风险模型1年、3年和5年总生存率的AUC值分别为0.65、0.68、0.70和0.55、0.60、0.60(TCGA-STAD和GSE62254)。xCell分析结果显示与高风险组相比,低风险组的免疫细胞表达量显著增高(P<0.05)。整合风险模型和临床特征的诺模图在TCGA-STAD和GSE62254中的C-index值分别为0.668和0.722,优于其他任何单独指标。与癌旁正常组织相比,OSBPL1A在胃癌组织中表达下调(t=2.348,P<0.05),MOGAT1在胃癌组织中表达上调(t=2.299,P<0.05)。结论 脂质代谢相关基因预后风险模型与胃癌患者的免疫浸润相关,可用于准确预测胃癌的预后。

  • 单位
    皖南医学院第二附属医院

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