运用MSAP技术测定谷子基因组DNA胞嘧啶甲基化水平

作者：张雨欣; 阮亚男; 赵宸; 薛敏敏; 李博; 王晶晶; 刘洋; 王凯玺; 王红艳^*

来源：生物工程学报, 2019, 35(02): 263-269.

DOI：10.13345/j.cjb.180220

• DNA甲基化
• 谷子
• 甲基化敏感扩增多态性(MSAP)

DNA甲基化是真核生物一种重要的表观修饰形式。为了探讨谷子基因组DNA胞嘧啶甲基化的水平和模式,以谷子Setaria italica的两个品种朝谷58号和豫谷1号为实验材料,利用Eco RⅠ和HpaⅡ/MspⅠ双酶切建立适合于谷子基因组的甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析体系。结果表明,从100对MSAP选扩引物中,筛选出32对MSAP引物组合,在朝谷58号和豫谷1号中分别扩增产生1 615、1 482条清晰可辨且可重复的DNA条带,其中包括3种类型的甲基化条带,朝谷58号和豫谷1号的基因组中CCGG序列胞嘧啶甲基化水平分别为6.93%和8.77%。这种谷子不同品种间甲基化水平和分布位点的差异为从表观遗传学的角度培育新品种提供了初步的理论依据和参考。

• 单位
  辽宁大学