怀玉山高山马铃薯胁迫相关蛋白基因的克隆和序列分析

作者：洪森荣; 余淑铃; 曾欣怡; 赵海玲; 郑怡婷; 周军; 朱金晶; 朱丽倩; 蔡红; 陈荣华

来源：天津师范大学学报（自然科学版）, 2021, 41(05): 46-51.

DOI：10.19638/j.issn1671-1114.20210506

• 怀玉山高山马铃薯
• 试管苗
• 胁迫相关蛋白基因
• 克隆
• 序列分析

为了揭示怀玉山高山马铃薯胁迫相关蛋白的生物学功能,从试管苗转录组数据库中筛选到胁迫相关基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆出怀玉山高山马铃薯的胁迫相关蛋白基因,并采用生物信息学方法进行序列分析.结果表明,怀玉山高山马铃薯胁迫相关蛋白基因的cDNA总长度为681 bp,G+C含量为47.58%;该蛋白由226个氨基酸组成,相对分子质量为24 781.71,等电点为9.16,是亲水性蛋白.怀玉山高山马铃薯胁迫相关蛋白的二级结构由α-螺旋(42.48%)、β-片层(15.93%)以及无规则卷曲(41.59%)构成,C端含有无规则卷曲,N端含有β-片层和无规则卷曲,且无规则卷曲、β-片层和α-螺旋散布于整个蛋白质中;三级结构为二聚体.胁迫相关蛋白主要存在于细胞核、叶绿体、细胞质、线粒体和细胞外.怀玉山高山马铃薯胁迫相关蛋白在进化上与Solanum tuberosum(马铃薯)胁迫相关蛋白亲缘关系最近.

• 单位
  上饶市红日农业开发有限公司; 生命科学学院; 上饶师范学院