miR-4472的靶基因预测及生物信息学分析

作者：刘珏; 陈星光; 朱雯; 侯秋英; 张旭; 沈方方; 滕懿群^*

来源：浙江医学, 2020, 42(13): 1377-1380.

• 新生儿缺氧缺血性脑病
• miR-4472
• 靶基因
• 信号通路
• 生物信息学

目的应用生物信息学分析方法预测miR-4472的靶基因及信号通路。方法利用miRBase数据库分析miR-4472的物种保守性;利用Targetscan、miRDB数据库进行靶基因预测,再用DAVID数据库将miR-4472的预测靶基因集合进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)生物通路富集分析。结果 miR-4472预测的交集靶基因共378个。GO分析结果显示,miR-4472的靶基因主要参与转录的正负调节、细胞凋亡、蛋白质磷酸化等生物过程(均P<0.01)。KEGG信号通路分析结果显示,miR-4472的靶基因显著富集于PI3K-Akt信号通路、胰高血糖素相关信号通路、心肌细胞中的肾上腺素能信号传导通路、醛固酮的合成和分泌相关信号通路(均P<0.05)。结论 miR-4472靶基因富集的信号通路均与新生儿缺氧缺血性脑病密切相关,尤其是P13K/AKt信号通路。