京星黄鸡IMF系全基因组选择信号检测分析

作者：王永丽; 刘晓静; 崔焕先; 文杰^*

来源：中国家禽, 2022, 44(12): 14-20.

DOI：10.16372/j.issn.1004-6364.2022.12.003

• 京星黄鸡
• 选择信号
• 功能分析
• 候选基因
• 肌内脂肪

为研究京星黄鸡肌内脂肪（Intramuscular fat,IMF）性状的遗传基础，研究选用十六世代IMF选择系（n=252）和对照系（n=264）群体，使用XP-EHH和ΔCLR方法分析两个群体基因组选择信号分布情况，挖掘与京星黄鸡IMF性状相关的基因。结果显示：选择系IMF、甘油三酯（Triglyceride,TG）、活重、屠体重等指标均显著高于对照系；XP-EHH与ΔCLR分别注释到678和1 099个基因，共同筛选到264个候选基因，这些基因与脂代谢、生长发育、神经发育等生物学过程有关，并鉴定到ACSL3、ACSL4、GPX1、IRS4、MAPK8、PLA2G4A、PTGS2、MGLL和PLCB1等9个脂代谢关键候选基因。研究表明，IMF含量的表型选择引起了基因组水平变化，鉴定到9个脂肪代谢关键基因，并发现一些可能与生长和神经发育等相关的基因，为IMF遗传基础研究提供参考。

• 单位
  动物营养学国家重点实验室; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所