肺炎克雷伯菌泛耐药株的质粒耐药元件研究

作者：朱健铭; 姜如金; 吴康乐; 翁幸鐾; 孔海深

来源：疾病监测, 2015, 30(02): 134-139.

• 肺炎克雷伯菌
• 质粒
• 泛耐药
• 全基因组测序
• 耐药编码基因
• 重金属离子
• 转座子
• 插入序列

目的通过对泛耐药肺炎克雷伯菌JM45的质粒1(p JM45-1)耐药元件分析,从基因组水平研究其泛耐药的遗传学基础。方法采用第二代高通量测序技术平台进行全基因组测序,生物信息学方法分析p JM45-1质粒的耐药元件,并与已在NCBI登录的质粒序列作聚类分析(Fast Minimum Evolutin法)。结果 p JM45-1质粒大小为317 156 bp,功能注释分析发现该质粒为可接合转移质粒,携带了抗菌药物耐药编码基因、重金属离子耐受编码基因、毒素编码基因和转座子以及插入序列等83个耐药相关编码基因。p JM45-1质粒与耐药质粒R100(登录号:AP000342.1)的全长94 281个序列中的45 995个序列有99%相同;与接合性质粒F质粒(登录号:AP001918.1)的全长99 159个序列中的8322个序列有87%相同。p JM45-1质粒与源自肺炎克雷伯菌的质粒在同一簇(cluster),与源自其他肠杆菌的质粒不在一个簇。结论肺炎克雷伯菌JM45 p JM45-1质粒携带大量耐药元件,是该菌株进化为泛耐药的主要原因。p JM45-1是可接合转移质粒,可将耐药基因在细菌间进行水平转移,造成耐药菌的播散。

• 单位
  杭州市余杭区中医院; 宁波市第一医院; 浙江大学医学院附属第一医院; 传染病诊治国家重点实验室