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摘要
miR171家族广泛存在于植物基因组中，探讨miR171成员在基因组中的起源、序列特征及与靶基因的作用特点，有助于拓展miR171对植物基因调控作用的认知。本研究基于测序的毛果杨基因组序列，对miRNA171 家族成员进行染色体定位，分析miRNA171的起源；利用DNAMAN软件对杨树miR171成员碱基组成进行比对，利用PSRNAtarget软件预测miR171的靶基因，揭示不同成员的特征及功能差异。结果显示，杨树miR171家族包含4个5p和13个3p成员，源于13个前体miRNA序列。其中miR171a前体来自CDS区，其它前体均来源于基因间隔区。序列比对发现，17个成熟miRNA中包含9个单一的序列，差异碱基数在1～8 bp之间。靶基因预测显示，miR171主要调控转录因子GRAS的表达，也参与了包括MYB、bHLH转录因子、蛋白激酶、水解酶等基因的表达调控。对核心位点的分析显示，7个杨树miR171成员通过切割模式调控靶基因mRNA的转录水平，4个杨树miR171成员对靶基因的作用通过翻译抑制的方式进行。miR171家族成员序列变异丰富，参与了多种靶基因的表达调控，在植物生长及逆境抗性等过程中具有重要的作用。
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