中国4省猕猴桃细菌性溃疡病菌的生物型检测和遗传多样性分析

作者：代玉立; 兰成忠; 甘林; 刘晓菲; 龚国淑^*; 杨秀娟^*

来源：植物保护, 2022, 48(06): 58-68.

DOI：10.16688/j.zwbh.2022339

• 猕猴桃细菌性溃疡病菌
• 生物型
• 遗传多样性
• 多基因联合分析
• 猕猴桃

由丁香假单胞菌猕猴桃致病变种Pseudomonas syringae pv.actinidiae(Psa)侵染引起的猕猴桃细菌性溃疡病(kiwifruit bacterial canker)是全球猕猴桃生产上最具毁灭性的细菌病害。为探明福建、安徽、四川和陕西4省Psa菌株的生物型和遗传多样性，用5对PCR特异性引物PsaJ-F/-R、PsaK-F/-R、Tac-F/-R、Con002-F/-R和avrRps4-F1/-R2检测Psa菌株的生物型；用4对PCR引物27F/1492R、PsaF1/R2、gapA-Fps/Rps和rpoD+364s/-1222ps分别扩增16S rRNA、ITS、gapA和rpoD基因，进行多基因联合分析Psa菌株的遗传多样性。结果表明，特异性引物Tac-F/-R从47株Psa菌株中均能扩增出一条545 bp的特异条带，其他4对引物未扩增出任何条带，说明供试Psa菌株的生物型均为biovar 3。多基因联合分析表明，4省Psa存在丰富的遗传多样性，4个群体共检测出27个单倍型，单倍型多样性为0.955。安徽、福建、四川和陕西群体的单倍型数差异较大，分别为1、8、12个和12个。4个群体的多态性位点数、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数差异极显著(P<0.01),其中福建群体的多态性最丰富，而安徽群体的多态性最低。AMOVA分析表明，3.6%的遗传变异来源于种群间，而96.4%的遗传变异来源于种群内，说明种群内变异是遗传变异的主要来源。遗传分化分析表明，安徽省Psa群体与其他3个群体间的遗传分化极高(Fst>0.175),福建、四川和陕西群体间的遗传分化水平较低(Fst<0.017)。研究结果有利于了解福建省Psa的来源，为阻断Psa的传播和猕猴桃细菌性溃疡病的长期可持续控制提供了理论参考。

• 单位
  四川农业大学; 福建省农业科学院植物保护研究所