VMD在分子间相互作用教学中的应用——以丙氨酸二肽与水形成的氢键为例

作者：郑舒琳; 钟容臻; 代亚楠; 蔡开聪^*

来源：化学教育 (中英文), 2022, 43(24): 95-100.

DOI：10.13884/j.1003-3807hxjy.2022030047

• VMD软件
• 氢键
• 径向分布函数
• 空间分布函数

在“计算机在化学中的应用”课程教学中，借助VMD软件揭示溶液中丙氨酸二肽(ALAD)与水分子间存在的氢键作用及其对多肽分子结构的影响。课堂教学过程中将有机化学中抽象的氢键以三维立体动画的形式在课堂上展示，并在上机实践教学中引导学生从定性和定量的角度对多肽与水分子间的氢键相互作用机制进行解析，能够丰富教师课堂教学手段，深化学生宏微观探析、证据推理与模型认知的化学学科核心能力。

• 单位
  材料学院; 福建师范大学