摘要
目的 构建并评估结肠癌坏死性凋亡相关长链非编码RNA(LncRNA)预后预测模型。方法 从美国癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取结肠癌患者转录组数据和临床数据,从京都基因和基因组百科全书(KEGG)数据库获取坏死性凋亡相关基因,使用R软件采用共表达分析得到坏死性凋亡相关LncRNA。采用Kaplan-Meier分析、单因素、多因素Cox回归分析筛选可作为结肠癌独立预后因素的坏死性凋亡相关LncRNA并构建预后模型。采用受试者工作特征曲线(ROC)评价该模型的灵敏性和特异性,为进一步验证该模型并拓展其临床应用,将9-LncRNA结合临床性状构建临床列线图并绘制校准曲线。结果 共识别9种坏死性凋亡相关LncRNA,包括AC010973.2、LINC01011、AC027307.2、CD27-AS1、LINC02474、AC044802.2、LBX2-AS1、TNFRSF10A-AS1、B4GALT1-AS1,成功构建了坏死性凋亡相关9-LncRNA预后模型,并将患者分为高风险组和低风险组,Kaplan-Meier分析显示高风险组患者总生存期短于低风险组患者(P<0.001)。绘制ROC曲线,1、3、5 a生存期的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.728、0.777、0.754,提示该模型预测效能较好。进行多因素Cox回归分析显示预后模型是结肠癌预后的独立风险因素。构建临床列线图并绘制校准曲线,计算一致性指数(C指数)为0.816,95%可信区间为0.77~0.87,提示该列线图对结肠癌的预后预测和实际预后较为符合。结论 基于9种坏死性凋亡相关LncRNA构建的预后风险模型对于结肠癌患者具有较好的预测效能,同时为结肠癌靶向治疗提供新思路。
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