生物节律紊乱与阿尔茨海默症关联基因的生物信息学挖掘

作者：张浩婷; 宋桂芹; 崔若彤; 郝敏; 王文栋^*

来源：神经药理学报, 2020, 10(03): 1-7.

• 阿尔茨海默症
• 生物钟基因
• 互作分析
• 染色体定位
• 基因本体论

目的:挖掘阿尔茨海默症与生物节律紊乱相关联的治疗性分子靶标。方法:从基因表达综合数据库GEO中获取GSE28146芯片数据,使用R软件挖掘、筛选差异表达基因;利用文本挖掘和蛋白互作筛选出与生物节律紊乱相关联的阿尔茨海默症基因,并对其进行染色体定位、功能注释和通路分析。结果:挖掘出372个阿尔茨海默症差异表达基因,在染色体上分布广泛,参与转录调控和免疫应答等过程;TIPIN基因既属于阿尔茨海默症差异表达基因又属于生物节律紊乱基因;有34个阿尔茨海默症差异表达基因与43个生物节律基因发生互作。结论:生物节律紊乱与阿尔茨海默症的发生密切相关。

• 单位
  河北北方学院