鸡FGF13基因生物信息学及组织表达分析

作者：邢伟杰; 赵东伟; 李尚民; 范建华; 蒋一秀; 金波^*

来源：中国家禽, 2019, 41(21): 11-16.

DOI：10.16372/j.issn.1004-6364.2019.21.003

• 鸡
• 成纤维细胞生长因子13
• 序列分析
• 结构预测
• 表达模式

研究使用多种生物信息学分析软件和多种在线生物信息分析工具,探究鸡成纤维细胞生长因子13(FGF13)基因及其编码蛋白的序列结构及遗传学特性,并分析其组织表达情况。结果显示:鸡FGF13基因编码区DNA序列长582 bp,共编码氨基酸193个;同源性分析发现,鸡FGF13基因具有较高的保守性,其核苷酸序列及其编码的氨基酸序列与鸟类中鸽和火鸡的同源性均达95%以上;氨基酸序列分析发现,该蛋白为不稳定的水溶性蛋白,分子质量为21.65 ku,理论等电点为9.33,无信号肽序列;亚细胞定位主要为细胞核内,属于非分泌蛋白;预测含有30个磷酸化位点,3个糖基化位点,具有FGF结构域;二级结构主要以无规则卷曲和β折叠为主,三级结构为卷曲状折叠结构;该基因在鸡早期生长过程中随周龄的增大在腿肌中的表达量呈下降模式。研究结果为FGF13基因功能的进一步分析,以及该基因在鸡生长发育及其他方面调控作用研究提供了更充分的分子生物学基础信息和理论依据。

• 单位
  江苏省家禽科学研究所