水稻胚性愈伤诱导率性状QTL的全基因组关联分析

作者：陈倩茹; 郑文茵; 曹邓伊; 姚威; 林晋军; 陈文凤; 黄浩; 丁晓雯; 黄希来; 吴俊; 刘雄伦; 刘金灵^*

来源：基因组学与应用生物学, 2023, 42(08): 821-831.

DOI：10.13417/j.gab.042.000821

• 水稻
• 愈伤诱导率
• 全基因组关联分析
• 数量性状位点

胚性愈伤组织的培养是水稻（Oryza sativa）遗传转化和功能基因组学研究的关键。为了评价不同类型的水稻种质资源的胚性愈伤组织诱导能力的差异，鉴定水稻胚性愈伤诱导性状调控相关基因，本研究以6个亚群的191份水稻种质为材料，分析了不同类型种质的胚性愈伤诱导力变异，利用全基因组关联分析（genome-wide association analysis,GWAS）定位了与胚性愈伤诱导率相关的数量性状位点（quantitative trait locus,QTL）。结果表明，6个亚群内不同品种间愈伤诱导率变异大，变异系数在17.86%～42.91%。平均胚性愈伤诱导率为籼稻（IND）>热带粳稻（TRJ）>温带粳稻（TEJ）>秋稻（AUS）>香稻（AROMATIC）>中间型（ADMIX），但是不同亚群品种间平均愈伤诱导率差异不显著。全基因组关联分析鉴定30个与愈伤诱导率显著关联的QTL，预测获得其中15个QTL位点是与胚性愈伤诱导率相关的候选基因，编码生长素信号调控相关蛋白、驱动蛋白、AP2结构域包含蛋白、磷酸酰肌醇-4-磷酸5-激酶蛋白、受体类蛋白激酶和同源异形盒编码蛋白等。这些结果为进一步克隆水稻胚性愈伤诱导调控相关基因，揭示胚性愈伤诱导的分子遗传机制奠定基础。

• 单位
  作物基因工程湖南省重点实验室; 湖南农业大学; 南方粮油作物协同创新中心