基于福建柏转录组数据的NAC转录因子鉴定和分析

作者:徐艳萍; 杨靖; 周成城; 荣俊冬; 陈礼光; 陈凌艳; 何天友; 郑郁善
来源:分子植物育种, 2022, 1-13.

摘要

本研究利用生物信息学方法对福建柏根、皮、叶3个组织的转录组数据中的NAC转录因子进行鉴定和分析。结果表明:福建柏转录组序列中共含有85个NAC转录因子;85个福建柏NAC转录因子的预测结果均为亲水性不稳定蛋白;亚细胞定位预测结果显示均定位在细胞核中;GO功能注释分类共注释到822个GO terms,分别聚类在分子功能、生物学过程和细胞组分上的数量为171、501和150;在与拟南芥NAC转录因子共同构建的进化树中,85个FhNAC被归入拟南芥的11个亚类中,其中NAC2亚类包含的成员最多,有22个。FPKM表达模式分析表明FhNAC的表达具有组织特异性,RT-qPCR结果验证了部分FhNAC基因的组织特异性。