基于WGCNA分析鉴定糖尿病肾病新的诊断标志物

作者：安敏; 杨晓玲; 马亮; 付少杰; 马福哲^*

来源：中国实验诊断学, 2023, 27(11): 1281-1287.

• 糖尿病肾病
• 诊断标志物
• DUSP1
• FOSB
• WGCNA分析

目的 基于生物信息学技术鉴定糖尿病肾病(DKD)新的诊断标志物。方法 在基因综合表达数据库(GEO)中筛选DKD与正常肾小球组织中的差异表达基因(DEGs),并通过加权基因共表达网络(WGCNA)筛选关键基因模块，获得关键DEGs。进行基因本体论功能(GO)以及基因组百科全书通路(KEGG)富集分析，以及蛋白互作(PPI)分析获取核心基因。绘制核心基因的受试者操作特征(ROC)曲线，筛选出诊断效能较好的基因作为诊断标志物，并进行基因集富集分析(GSEA)以及免疫浸润分析。结果 共鉴定出87个DEGs,其中39个在DKD中上调，48个下调。WGCNA显示橙色模块为关键模块，共获得14个关键DEGs。对关键DEGs的GO富集结果主要富集于白细胞趋化、趋化因子结合等，KEGG富集结果主要富集于白细胞介素17、肿瘤坏死因子等信号通路。PPI分析鉴定出5个核心基因，ROC曲线提示DUSP1及FOSB具有较好的诊断效能(AUC=0.941,AUC=0.900),被筛选为潜在诊断标志物。GSEA富集分析结果提示随着标志物表达的增加，色氨酸代谢、脂肪酸代谢等通路被抑制。免疫浸润结果发现这两个标志物的表达均与免疫细胞的浸润密切相关。结论 DUSP1和FOSB对DKD具有良好的诊断效能，并与DKD肾小球免疫细胞浸润相关，有望成为DKD的新型诊断标志物及治疗靶点。

• 单位
  吉林大学第一医院; 唐山职业技术学院