灰毡毛忍冬Lm-XL-AP1基因克隆、生物信息学和时空表达分析

作者：彭美晨; 刘湘丹; 徐玉琴; 王珊; 刘畅宇; 陈勋; 周日宝

来源：中草药, 2018, 49(07): 1652-1660.

• 灰毡毛忍冬
• Lm-XL-AP1基因
• 生物信息学
• 荧光定量
• 克隆

目的克隆灰毡毛忍冬突变型品种AP1基因(Lm-XL-AP1),并对其进行生物信息学和时空表达分析。方法通过RACE技术克隆Lm-XL-AP1基因全长,运用生物信息学的方法进行基因同源性和相似性比较分析,预测其编码蛋白,并对其进行各种理化性质分析。运用荧光定量PCR(q RT-PCR)检测该基因在灰毡毛忍冬突变型植株不同花期和不同器官的相对表达量。结果获得AP1基因,开放阅读框(ORF)长729 bp,编码242个氨基酸,与甘菊中MADS-box基因家族AP1基因相似性达80%,且包含MADS和K-box的保守序列。AP1蛋白无跨膜区域,定位于细胞核中;在灰毡毛忍冬突变型植株第6花期相对表达量最高,同时茎、叶中也有表达。结论成功从灰毡毛忍冬突变型植株总RNA中克隆到可能参与控制花器官表达的AP1基因。

• 单位
  湖南中医药大学第二附属医院; 湖南中医药大学; 湖南中医药大学第一附属医院