基于生物信息学分析CCNB1、ASPM和AURKA作为肝细胞癌预后标志物的潜力

作者：蒲俊兴; 何颖; 陈娟娟^*

来源：实验与检验医学, 2022, 40(01): 30-34+54.

• 肝细胞癌
• 生物信息学
• 差异表达基因
• 预后标志物

目的 本研究基于生物信息学分析，探寻肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）发生发展的枢纽基因，为HCC患者的预后提供潜在的生物标志物。方法 从GEO数据库下载两个肝细胞癌芯片数据（GSE14520和GSE46408），通过GEO2R筛选HCC组织和正常肝组织之间的差异表达基因（DEGs）。利用STRING数据库构建DEGs的蛋白质互作（PPI）网络，并用Cytoscape软件的CytoHubba插件计算PPI中各基因的连接度，筛选出枢纽基因。通过利用ONCOMINE、GEPIA2、cBioPortal、GeneMANIA、DAVID6.8和TIMER数据库对筛选出的枢纽基因进行转录、翻译、生存情况和肿瘤免疫浸润相关性等方面的验证，并分析其是否具有作为HCC预后生物标志物的潜力。结果 筛选出3个枢纽基因（CCNB1、ASPM和AURKA），且均在HCC中高表达。生存分析表明这3个基因均与HCC患者的总体生存率和无病生存率显著相关。肿瘤免疫浸润分析结果进一步提示CCNB1、ASPM和AURKA可能是HCC潜在的预后标志物。结论 CCNB1、ASPM和AURKA可能是HCC发生发展的枢纽基因，具有成为HCC预后标志物的潜力。

• 单位
  南昌大学; 南昌大学第二附属医院; 公共卫生学院